改善医疗服务进行时——内蒙古妇幼保健院开展本地化全外显子组检测
发布来源:内蒙古自治区妇幼保健院 发布时间:2020-06-24 09:41:43
根据世界卫生组织的报道,80%以上的异常儿童是由于先天基因遗传缺陷所致。遗传性疾病病种多、临床表现复杂多样、临床医生常常束手无策,无法诊断。基因检测是遗传性疾病确诊的重要工具和手段。随着基因检测技术的发展,全外显子组检测以快速、精准的优势成为遗传性疾病诊断的新技术。
日前,内蒙古自治区妇幼保健院收治的一名3个月女婴,因反复强直/阵挛性癫痫入院。医生查体发现,肌张力低下。血常规、血气、肝肾功能、血氨正常。血及脑脊液的长链脂肪酸、氨基酸正常,脑脊液糖浓度正常。血乳酸略增高。新生儿筛查时脑干听觉诱发电位显示严重神经性耳聋。
由于临床无法确诊,进行全外显子检测,查找病因。全外测序显示:生物素酶基因BTD 发生纯合致病变异。后查血生物素酶 0 nmol/min/mL (正常值= 4-15)。结合全外显子组检测和血生物素酶结果,临床治疗方案调整为:20mg 生物素/天,约0.8元人民币一天。数天后患儿癫痫次数开始降低,随后彻底消失。3个月后肌张力恢复正常。一岁时听力检测正常,并开始说简单词汇。
通过一代测序验证该患儿父母为该病致病变异的携带者,为父母再次生育提供针对性的生育指导。临床中类似的遗传类疾病仅凭症状和初步的检查有时无法确诊,为满足广大就诊患者和医生的需求,遗传优生科经过一年的前期准备工作,于2020年5月开始,正式开始接收全外显子组检测样本,成为内蒙古自治区首家能够自主完成全外显子组测序检测的医疗单位。这一技术的开展,使该院分子诊断技术得到了大幅提升,迈入国内领先行列。
什么是全外显子组检测技术?
人类外显子组包括22,000多个基因的180,000多个外显子, 整体长度仅占人类基因组的1-2%,但85%以上单基因遗传病都是由外显子突变导致的。全外显子组检测采用高通量测序技术,对目前已知的人类全部基因的外显子区进行测序,然后结合生物信息学分析鉴定外显子区域内所有突变信息,进而发现疾病相关的致病基因。
全外显子组测序技术具有高灵敏度、高特异性、高选择性、覆盖范围广、诊断效率高、费用相对低廉等特点,。该技术的特性使其非常适合表型复杂的遗传疾病的检测,在罕见遗传病尤其是单基因遗传病的临床诊断中发挥着重要作用。实现了一次实验检测多种疾病的要求,被称为遗传性疾病研究与健康筛查的利器。
哪些人群适宜进行全外显子测序检测?
① 有明确家族遗传病史的患者。
② 具有非典型性疾病特征,或经过多种医学检测未查明致病原因的患者。
③ 常规检测病因不明的患者。
④ 涉及某一脏器或多脏器综合征的、临床表型提示涉及单基因疾病的患者。
⑤ 不明原因体格发育迟缓、智力发育迟缓、多神经发育异常、精神状态异常的患者。
⑥ 患专科疾病反复发作久治不愈的患者。
全外显子测序检测的局限性
① 所有的检测方法都有它的适应症和禁忌症,不可能用一个检测来解决所有问题。全外显子测序技术也不例外。
② WES不能检测非整倍体、多倍体、平衡易位、CNV等染色体异常;
③ WES无法检测因内含子突变引起的各种疾;
④ WES对基因组部分特定区域,难以有效覆盖,可能存在漏诊的状况(董 弘 张丽春)